Obtuvo fama y reconocimiento internacional por haber sido el vocalista, guitarrista y compositorprincipal de la banda de rock Soda Stereo, una de las bandas más importantes e influyentes de la música latina. Luego de la disolución de la banda, obtuvo también reconocimiento y éxito en su carrera solista, que consta de cinco álbumes de estudio y de diversas incursiones junto a otros músicos. Su camino como solista se inició a comienzos de los años noventa, en paralelo a dicha banda, debido a un receso que se había tomado el grupo tras una fuerte crisis. En esa instancia Cerati publicó su primer álbum como solista, Amor amarillo; pero con el regreso de Soda Stereo su carrera solista quedó en suspenso hasta la disolución absoluta de la banda.

Después de Soda Stereo, Cerati experimentó con diferentes estilos, desde la música electrónica(Plan V) a la música sinfónica. En 2007 Soda Stereo regresó en una gira llamada Me verás volver, luego de la cual sus integrantes retomaron sus actividades por separado. El 15 de mayo de 2010 padeció un accidente cerebrovascular isquémico, que lo dejó en estado de coma por más de cuatro años, falleciendo el 4 de septiembre de 2014 a causa de un paro respiratorio en la Clínica ALCLA de Buenos Aires.
A lo largo de su carrera como solista ganó y fue nominado para numerosos premios, entre ellosGrammy Latino, Konex, MTV y Gardel. El 5 de diciembre de 2013, el músico fue nombradoCiudadano ilustre, una distinción que le fue otorgada por la Legislatura de la CiudadAutónoma de Buenos Aires  en reconocimiento a su trayectoria.

En su edición de septiembre de 2012, la revistaRolling Stone posicionó a Cerati en el puesto n° 7 de los 100 mejores guitarristas del rock argentino.